高昌区（维吾尔语：قاراھوجا رايونى）是中华人民共和国新疆维吾尔自治区吐鲁番市的一个市辖区。
清乾隆二十年（1755年），清廷平定准噶尔，控制吐鲁番地区。乾隆二十一年（1756年），额敏和卓率部迁回鲁克沁（今鄯善县鲁克沁）。乾隆二十三年（1758年）封额敏和卓为郡王。乾隆二十四年（1759年），清置辟展（今鄯善县城）办事大臣及同知，隶甘肃布政司。建吐鲁番六城：辟展（今鄯善县城）、吐鲁番城（今吐鲁番市东南）、鲁克沁、色更木（今胜金）、哈喇和卓、托克逊。办事大臣驻辟展。设办事大臣后，吐鲁番实行军府制与扎萨克制并行，扎萨克由郡王担任。清乾隆三十六年（1771年）设辟展巡检。清乾隆四十四年（1779年），辟展办事大臣改为吐鲁番领队大臣，及同知，移驻广安城（今吐鲁番市老城），行政中心移吐鲁番市。光绪十年（1884年）新疆建省，吐鲁番直隶厅成立，辖今吐鲁番、鄯善、托克逊范围。光绪二十八年（1902年），辟展巡检改置为鄯善县，隶属吐鲁番厅。
英国殖民者荣赫鹏于1887年在由北京去印度途中经过吐鲁番。他提到吐鲁番当时由两个分开的城池组成，其中一个是人口近5000的汉城，另一个是位于汉城西边一英里（1.6千米）的回城，人口在12,000至15,000人之间。回城城池四方各有一个城门，城门为砖砌并有结实的木门板，木门上装饰着铁片且被半圆形防御工事包裹着。粘土夯砌的城墙保养得很好，有大约35英尺（10.7米）高、20至30英尺（6米至9米）厚，墙顶有射击孔。筑城墙外围的空地约15码（14米）处又有一层约6英尺（2.4米）高的步枪射击用墙，墙下更有条12英尺（3.7米）深、20英尺（6米）宽的壕沟。鼓楼部署在几个入口处，小方塔立在城池的四个角，城门与城墙转角处之间设有两座小的方形防御工事，“每面各两个”。四周围的田野中种植了小麦、棉花、罂粟、瓜果葡萄等。
高昌区地处天山中东部主峰博格达山南麓，吐鲁番盆地中心。东西宽90公里，南北长262公里，地势南北高，中间低。土地总面积13589平方公里。东临哈密，西、南与巴音郭楞蒙古自治州的和静、和硕、尉犁、若羌县毗连，北隔天山与乌鲁木齐市及昌吉回族自治州的奇台、吉木萨尔、木垒县相接。距新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市183公里。高昌区山地面积占23%，平原面积占77%，戈壁面积占60%。吐鲁番的自然环境十分特殊，是中国地势最低、气候最热的地方。根据地质考察，这里原是一个内海，后经造山运动才变为陆地。整个盆地大体是北高南低。北部博格达峰拔海5445米，山顶终年积雪，是盆地的主要水源。火焰山横亘中央，把全区分成山北、山南两部分。艾丁湖位于南部，低于海平面154米，是全国陆地最低的地方。市城海拔为34米。土壤以砂壤和黄色粘土为主，属微碱性，有机质少。
吐鲁番的气候属于冷沙漠气候（柯本BSk），日照充足，极端干燥，降雨稀少且大风频繁，故有“火洲”、“风库”之称。这里全年日照时数为3000～3200小时左右，比我国东部同纬度地区多1000小时左右，太阳年辐射量139.5～150.4千卡/平方厘米，比同纬度的华北、东北地区多15～20千卡/平方厘米，仅次于青藏高原。全年平均气温13.9℃，高于35℃的炎热日在100天以上。夏季极端高气温为49.6℃，地表温度多在70℃以上，有过82.3℃的纪录。当地素有“沙窝里烤熟鸡蛋”、“石头上烤熟面饼”之说。冬季极端最低气温-28.7℃;日温差和年温差均大，全年10℃以上有效积温5300℃以上,无霜期长期达210天左右。由于气候炎热干燥，这里干旱少雨，年平均降水量仅有16.4毫米，而蒸发量则高达3000毫米以上。2011年7月14日，吐鲁番艾丁湖还曾观测到目前中国的极端最高气温——50.2℃。
高昌区下辖4个街道办事处、5个镇、4个乡：
老城街道、高昌街道、葡萄沟街道、红柳河街道、七泉湖镇、大河沿镇、亚尔镇、艾丁湖镇、葡萄镇、恰特喀勒乡、二堡乡、三堡乡、胜金乡和原种场。
截至2020年，根据第七次全国人口普查数据结果，高昌区常住人口317443人。
根据2000年人口普查，高昌区有人口251,652（人口密度为15.99 inh./km²）。民族构成如下：
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