电子联行使用的会计凭证有以下三种：
1.电子联行转汇借(贷)方清单。此清单一式三联。*9联为发报依据，由发报行录入员凭以录入电子计算机发往转发行；第二联为记账联，发报行作为与汇出行往来科目的记账凭证；第三联是回单，由发报行加盖转讫章后退汇出行。
2.电子联行往账借(贷)方清单。此清单一式两联。*9联由发报行作为与汇出行往来科目的记账凭证的附件；第二联发报行作为电子联行往账卡片。
3.电子联行来账借(贷)方清单。此清单一式三联。*9联收报行作为电子联行来账卡片；第二联收报行作为与汇入行往来科目的记账凭证的附件；第三联由收报行加盖转讫章后交汇入行。
