如果发票抬头开给母公司，母公司可以作为管理费用入账（报销），但钱又从你们子公司出的，只能作为往来款处理。
分录如下：
借：其他应收款—母公司
贷：库存现金 等
将来母公司归还时，或向母公司上交利润时再核销
借：银行存款
贷：其他应收款—母公司
或者
借：利润分配—应付股利
贷：其他应收款—母公司
拓展资料：
独立核算的内涵
独立核算是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。
比如，一个企业有很多职能部门和下属自负盈亏的公司组成，则下属公司一般为独立核算单位，而各职能部门（如办公室）则一般为非独立核算单位。
非独立核算又称报帐制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。非独立核算单位的特点是：一般由上级拔给一定数额的周转金，从事业务活动，一切收入全面上缴，所有支出向上级报销，本身不单独计算盈亏，只记录和计算几个主要指标，进行简易核算。
非独立核算的分公司可以领用增值税发票，但前提是总公司也是一般纳税人。
独立核算单位的特点
在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户；独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同；独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。
独立核算或非独立核算属于税务上规定。一般情况下，在当地负有流转税纳税义务，即需要登记为独立核算性质分公司。也即是说，在当地从事经营活动的，就需要登记为独立核算性质。
分支机构在当地不从事经营活动，只是负责联络、售后服务等业务，在当地不涉及流转税的缴纳，可以登记为非独立核算性质。
因此，判断的关键在于分公司是否从事经营活动（销售货物或提供应税劳务），是否在当地缴纳增值税或营业税。
分公司为非法人资格，不可能取得法人资格营业执照。独立核算或是非独立核算与这个没有关系。营业执照里面的经营范围可以作为判断在当地是否从事经营活动的依据。
